继萌宝战警第二季之后，宇宙邪恶势力世星大帝以及余党铁算盘、塔库玛司令之类再次受到挫败，萌宝战警拯救了地球上的恐龙等古生物，这些活化石见证了整个地球的繁衍盛衰，同时也回归到了适合的生存环境，它们将于人类和谐共处。
一个偶然拥有“家庭”的杀手，在经历了家庭温暖、感受光明之后，要开始保护世界去赎罪的故事。
"在某个世界泡中，武装人偶与死士的冲突从未间断过。伴随着二者之间的冲突不断升级，世界泡的稳定性正逐渐降低。为了拯救这个即将崩坏的世界，人类成立了专门用来管理与控制人偶的组织。为了掩盖黑暗的真相，人类特地给组织取了一个非常可爱的名字——「人偶学园」……——啊哈哈，开玩笑的，怎么可能是那样呢？"
以受众熟悉的歌德发起出发召集令，召集大小朋友们在新一季和歌德一起出发，并肩前行探 索世界，在前进的旅程中发现世界的更多精彩，收获丰富的自然知识，见证彼此的成长。
段飞在前世死亡后竟重生回到20年前，在那一场病毒浩劫之前几小时关键时间点。段飞后悔20年的事情终于可以补救了，利用自己在前世20年的知识在现世好好武装自己，得到进化树的段飞不断在提升自己力量。原本在前世只能苟活的段飞在今世却是一个世界英雄
