《尼斯大冒险》故事讲述了一直都把自己当做海鸥的小雨燕马努，在严父的要求下努力学习各种海鸥的飞翔技能，却因为总是不得要领而饱受挫折。马努心灰意冷，离家出走，却在旅途中遇到了自己的同类，并重新认识自己作为雨燕的真实身份。在雨燕和海鸥家族共同面临的一场巨大灾难面前，小雨燕马努挺身而出，成为了大家的英雄……
时空背景设定在2509年，地球不只与USG石村号（USG Ishimura）和伊萨克．克拉克失去了联系，同时也与派去救援他们的USB欧班农号（USB OBannon）失联。欧班农号上有四名船员存活了下来，但是没有人知道其他成员的下落，也没有人知道他们遇上了什么事情，更没有人知道他们究竟隐藏了什么样的秘密。这一切的一切，全都将透过《余波》来揭晓
