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叶家灭门案还未正式结案，沈琦遗骸竟又引发灵异之事。幸好沈琦表妹——留学多年的物理学家沈玉及时回国，利用量子物理中针对“暗物质”的研究成果，发现原来巫女曲南燕并未死去，还附身到叶家老太太身上。

极端气候引起海平面上升，一名科学家警告人类一场足以毁灭地球的大洪水将要到来，但惨遭无视。于是他自己建造了一艘方舟。灾难到来时，那些曾经嘲笑科学家的人终于醒悟，向他求助。人们登上他的大船，在陆地被海洋吞噬前寻求求生的最后希望。

弗兰克被关在密室里，只有一台人工智能计算机负责维持生命，但无论怎样密室逃脱，只是回到另一个嵌套，随着时间发展，出现了新的情况。

1845年，尚年幼的维克多与詹姆斯兄弟俩在长辈之间一场突如其来争执中唤醒了自身的潜能，詹姆斯情急之下将陌生的生父杀死，自此兄弟两人流落战场，他们凭借不死不衰之身和野兽一般的天赋在各个时代的战争中大开杀戒，直到遇见史崔克少校并加入了他的异能人特殊部队。詹姆斯（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）很快厌倦了对弱势者的杀戮，离开了团队和维克多（列维·施瑞博尔 Liev Schreiber 饰），与女友凯拉隐居在山林中，做了一名伐木工人。六年后，詹姆斯惊闻昔日的超能力队友纷纷被杀害，而杀手正是哥哥维克多，不久连凯拉也遭其毒手，愤怒的詹姆斯与史崔克合作，将自己的身体改造，成为钢筋铁骨的“金刚狼”。金刚狼摆脱军方控制后，发誓要杀死维克多和史崔克为凯拉报仇……

纽约大战后，雷神索尔（克里斯·海姆斯沃斯 Chris Hemsworth 饰）将弟弟洛基（汤姆·希德勒斯顿 Tom Hiddleston 饰）带回仙宫囚禁起来，此外帮助九大国度平定纷争，威名扶摇直上。虽然父王奥丁（安东尼·霍普金斯 Anthony Hopkins 饰）劝其及早即位，但索尔念念不忘地球的美丽女孩简·福斯特（娜塔丽·波特曼 Natalie Portman 饰）。与此同时，简在和黛西及其助手伊安调查某个区域时意外被神秘物质入侵，却也因此重逢索尔，并随其返回仙宫。令人意想不到的是，藏在简体内的物质来自远古的黑暗精灵玛勒基斯（克里斯托弗·埃克莱斯顿 Christopher Eccleston 饰）。在“天体汇聚”的时刻再次到来之际，玛勒基斯企图摧毁九大国度，缔造一个全然黑暗的宇宙。
　　藏匿简的仙宫受到重创，而索尔和洛基这对冤家兄弟也不得不联手迎战宿命的强敌…

A dark and gritty re-imagining of the classic franchise.

影片以“末日”作为故事背景，讲述了几位主人公在拯救世界和自我救赎矛盾中的成长，是一部分歧与团结并存，友情与爱情交织的科幻主旋律的电影。