ZAP SPACY收到了求救信号，雷等人迅速驾驶盘龙号前往，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，雷他们遇见了其他次元的自己，并且出现了一头机械哥莫拉。
一艘巨大的外星无人探测器向地球航来，它不断地发出奇特的电波信号：功率强大的信号煮沸了海水，干扰了附近的星舰并造成了广泛的破坏。此时，詹姆斯·柯克中将与他的船员们在完成了让斯波克上校复活的任务后，驾驶着从克林贡人那抢来的猛禽舰（被改名为“赏金号”）从瓦肯星返航，尽管他们已经知道了将面临军事法庭的指控：他们被指控盗窃了联邦星舰进取号，并对她的毁坏负有责任。在此关头，尚在恢复中的斯波克发现这艘外星探测器正尝试与地球上的座头鲸建立联系；但不幸的是，早在3个世纪前座头鲸就因过度的捕猎而灭绝了。
孤儿杜文明偶然间被神秘人物告知必须杀死六名外星人后才可以揭开自己身世真相。便与好友梦琪深入外星人领地，执行任务中结识貌美性感的女外星人林静竹，坠入爱河。在梦琪的帮助下，杜文明几经周折杀死了三名邪恶的外星人，梦琪却为了搭救杜文明而失去了生命。悲痛之余，杜文明不得不独自继续更加凶险的屠龙之旅。
两个陌生的年轻人发现了一艘神秘的宇宙飞船，它将他们带回到数百万年前。
一个匿名杀手被交付一项谋杀计画，但他的一举一动似乎被有效地监视著。当他以为逃已经出这个圈套时，一通莫名的电话打来，他所谋杀的对象还活著，时空陷入错乱，印象中他所遭遇过的人事物都错乱了，他也发现自己不知不觉地杀了一个人。所有的事都没有逻辑，南辕北辙的两个结局，这是否就是那个神祕人所主导的谋杀计画，但目标其实是他……
