该剧改编自铃木宏的漫画，讲述了七名罪人组成的“七大罪”面对世界危机的故事。与第一部电影一样，这部动画基于铃木的全新原创故事，描绘了电视动画中延续的“超越最终章”。
故事发生在 12090 年，地点是一个偏远的小镇。被统治该地区的“贵族”李伯爵吸血的年轻女孩多丽丝雇佣了一名名为“D”的吸血鬼猎人。伯爵想要将多莉丝纳入自己的吸血鬼一族，但是他的女儿拉米卡却对此表示反对，而图谋永生的强盗团伙头目灵隐星也对此表示反对，于是他们与追捕伯爵的“D”之间展开了一场激烈的战斗。
在一个农场内，饲养着各种牲畜，它们都是农场主人的私有财产，等待他们的只有一生劳动以及最后被卖掉和被吃掉的下场。农场里的一头猪在提出了“人类剥削牲畜，牲畜须革命”的理论之后死去，不久农场便掀起了一场由猪领导的革命，原来的剥削者──农场主被赶走，牲畜们实现了“当家作主”的愿望，尝到了革命果实的甘美，农场更名为“动物农场”并且制定了农场的宪法── 七诫。
故事讲述了因为滑翔机运动而聚集在大学体育会航空部的一群少男少女们，以航空协会为舞台上演的一出出真实又让人感动的青春热血故事。
照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难……本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。
路人高中生结城宏机缘巧合得到了一部究极进化的RPG游戏“极·QUEST”。据说这个一部集结了技术的精华，“将现实还原至极”的游戏。视觉上的设计、NPC的举动、草木的味道和轻抚肌肤的风……所有的元素都仿佛现实。
