神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
男主萧宇作为一代天尊大能，因渡劫失败而陨落后重生回过去的人界。此时的他身份卑微，遭遇女友背叛，情敌欺压，同窗的冷嘲热讽。他决定凭借前一世的记忆与根基，踏实重修，稳固根基，并弥补过去的遗憾，去帮助曾经的伙伴，去修理曾经的敌人。现今杀伐果断，敢爱敢恨的他，这一世定将登顶巅峰，睥睨万界。
从僵尸到旱魃，再到祖尸爷
穿越修仙界，重生到天下第一宗青岚宗之中，身份更是显赫的元婴长老，这本应该是无比完美的开局，然而王麟却发现，系统给自己的任务却是‘毁掉自家宗门’，只要削弱宗门就能够获得奖励，最终变的天下无敌。 本想着建一个天下第一难，毁掉还不容易，然而王麟却发现事情似乎真的有些不简单。
三十年河东，三十年河西，莫欺少年穷！ 年仅15岁的萧家废物，于此地，立下了誓言，从今以后便一步步走向斗气大陆巅峰！ 经历了一系列的磨练：收异火，寻宝物，炼丹药，斗魂族。 最终成为斗帝，为解开斗帝失踪之谜而前往大千世界....
九千年前，仙武帝尊率领百万神将打入太古洪荒，却无一人归来，只有一缕真火遗留世间。九千年后，门派废徒叶辰，被赶出宗门，无以为家，机缘巧合之下偶得真火，再踏仙武之路。这是一个神魔仙佛并立的世界，这是一个诸天万域混乱的年代，叶辰的逆天征途，由此开始。
少年李怀风，八岁时误闯神秘古墓，阴差阳错唤醒了古墓主人轩辕落雪的灵魂，并被轩辕落雪附身，后收李怀风为徒。十年后李怀风为了给师父再次重铸灵魂而找到了这个古墓，却为救富家千金杜施施导致轩辕落雪因此灵魂重创，随后，下山入世的李怀风，为赚取资金帮助自己师父轩辕落雪恢复灵魂做准备而展开了冒险。
天宝十二年，天魔复生之期将至，妖王獬狱意图利用天魔统领妖族，颠覆人间，使人间成为妖族之地。人间驱魔司召集青年才俊重返长安，为四年之后的天魔现世做准备。在边境，驱魔司众人再度相聚，后续发现战死尸鬼的暴动。这一切的背后似乎都和传说中的白鹿有关，白鹿究竟在何处呢？
